Sezonul 5 din Deep Space Nine începe arcul Războiului Dominion care va domina restul spectacolului. Federația și aliații săi se confruntă cu un nou inamic sub forma alianței Cardassian-Dominion, care amenință să cucerească Cuadrantul Alfa.
S05E01
Sisko dezvăluie Comandamentului Flotei Stelare suspiciunea lui Odo că klingonianul Gowron este de fapt unul de-al lui Odo și i se cere să-l demaște pe metamorf.
S05E02
În timp ce explorează o lume din Cuadrantul Gamma, Sisko, Dax, Worf și O'Brien văd cum o navă de luptă Jem'Hadar se prăbușește pe suprafața planetei.
S05E03
La un pahar cu Dax, Worf este impresionat când o vede pe Grilka, o femeie klingoniană, care a venit pe stație cu Tumek și cu paznicul său, Thopok.
S05E04
Jake Sisko face un profil al dr. Bashir și în timp ce călătoresc într-o navetă Runabout, primesc un apel de ajutor de la o colonie a Federației atacată de klingonieni.
S05E05
Keiko revine de pe Bajor, iar O'Brien este șocat când află de la propria soție că, de fapt, ea este o entitate care posedează corpul lui Keiko.
S05E06
Darvin, un spion klingonian dezonorat, călătorește înapoi în timp pentru a modifica niște evenimente. Echipajul DS9 trebuie să afle ce vrea să modifice și să-l împiedice.
S05E07
Relația lui Worf cu Dax este afectată de probleme și el intenționează să discute despre sentimentele sale în timpul vacanței pe „planeta plăcerilor”, Risa.
S05E08
Sisko, Odo, Dax și Garak sunt găsiți fără cunoștință. În timp ce Bashir încearcă să-i readucă în simțiri, se trezesc în timpul ocupației cardassiene a planetei Bajor.
S05E09
Forțați să aterizeze pe o planetă pustie, Odo și Quark descoperă că și-au pierdut sistemul de comunicații, replicatorul și o mare parte din rații într-o explozie.
S05E10
Sisko vede o pictură care înfățișează B'hala, legendarul oraș pierdut de pe Bajor, și devine motivat să caute faimosul sit.
S05E11
Kira este surprinsă când Latha Mabrin, fost membru al vechii sale celule de rezistență, este ucis. Suspiciunile sale cresc odată ce primește un mesaj înregistrat.
S05E12
Kira intră în travaliu. Dar Odo se ocupă de propriul său „bebeluș”: fostul metamorf a cumpărat un copil metamorf bolnav de la Quark.
S05E13
Sisko îl întâlnește pe Michael Eddington, fostul său șef de securitate din Flota Stelară, care l-a trădat și s-a alăturat grupului Maquis.
S05E14
Stația preia un mesaj codificat din Cuadrantul Gamma care pare să fie cardassian. Garak dezvăluie că este un apel de ajutor de la mentorul său.
S05E15
Stația se pregătește de un atac din partea Dominionului, dar flota inamică se îndreaptă brusc spre spațiul cardassian. Nava lui Gul Dukat iese din formație și o urmează.
S05E16
Bashir este ales ca model pentru programul medicului holografic al Flotei Stelare și primește vestea de la dr. Zimmerman, omul de știință responsabil de proiect.
S05E17
Odo cunoaște o femeie frumoasă și este impresionat de puterea sa de observație. Mai târziu, este surprins să o vadă că încearcă să acceseze fraudulos computerul stației.
S05E18
Vărul lui Quark sosește pe stație și îi oferă o parte din afacerea sa cu armament, care ar putea plăti toate datoriile lui Quark într-o lună.
S05E19
Kira se întâlnește cu Tekeny Ghemor, un cunoscut dizident cardassian și speră că acesta va conduce opoziția față de alianța dintre cardassieni și Dominion.
S05E20
Deprimat, în special pentru că este trecut pe lista neagră a Autorității comerciale ferengi, Quark merge acasă pentru a găsi alinare la mama sa.
S05E21
Generalul Martok primește ordine de la Înaltul Consiliu Klingonian să caute o navă klingoniană, B'Moth, care a dispărut lângă granița cardassiană.
S05E22
În Cuadrantul Gamma, Dax investighează o planetă înconjurată de o barieră de energie, care scoate din uz naveta Defiant și generează o dublură a Kirei.
S05E23
Un mesaj secret îi este predat lui Sisko. Puținii teroriști Maquis care nu au fost uciși de către Dominion inițiază represalii masive împotriva planetei Cardassia.
S05E24
Deep Space Nine e în stare proastă, iar O'Brien nu poate reproduce materialele cardassiene necesare, așa încât conduce o misiune de recuperare pe o stație spațială.
S05E25
Quark vrea să scoată la licitație antichitățile, care includ un cartonaș de baseball de epocă cu Willie Mays, iar Jake decide să obțină cartonașul pentru tatăl său.
S05E26
Când un alt convoi de nave Jem'Hadar iese din gaura de vierme spre Cardassia, Sisko își dă seama că Dominionul preia controlul asupra Cuadrantului Alfa.